清算組在清理公司財產(chǎn)、編制資產(chǎn)負債表和財產(chǎn)清單后，擬定提出清算方案，報股東會討論通過或者主管機關確認。 清算方案的主要內(nèi)容有：清算費用、應支付的職工工資和勞動保險費、應繳納的稅款、清償公司債務、分配剩馀財產(chǎn)、終結(jié)清算工作。在清算進行完以后，才能進行注銷。
公司注銷過程需要分別去以下7個部門或機構(gòu)辦理相應賬戶注銷：
1、社保局：核查是否有未繳清社保費用，然后注銷公司社保賬號。
2、稅務局：核查是否有未繳清稅款或費用，然后注銷公司的國、地稅。
3、報紙媒體：公司需自行登報公示，宣告公司即將注銷。
4、工商局：辦理公司注銷備案，注銷營業(yè)執(zhí)照。
5、開戶行：注銷公司開戶許可證和銀行基本戶等其他賬戶。
6、質(zhì)監(jiān)局：到質(zhì)監(jiān)局注銷公司的許可證例如生產(chǎn)許可證。
7、公安機關：注銷公司印章的法律效應（印章本身可不上交）。

申請注銷前公司應開展公司清算，公司清算完成后便可進入公司注銷申請程序，清算后、注銷前公司需要出具和準備如下報告：
1、公司清算組負責人或公司法定代表人簽署的《公司注銷登記申請書》；
2、清算組成員《備案確認申請書》；
3、法院破產(chǎn)裁定、行政機關責令關閉的文件或公司依照《公司法》作出的決議；
4、股東會或者有關機關確認的清算報告；
5、刊登注銷公告的報紙報樣；
6、法律、行政法規(guī)規(guī)定應當提交的其他文件；
國有資公司還應當提交國有資產(chǎn)監(jiān)督管理機構(gòu)的決定，其中，確定的重要的國有資公司，還應當提交本級人民的批準文件。
清算動作進行前公司仍具有法人資格，其權利義務能力和行為能力都沒有發(fā)生變化；開始清算動作后，公司便進入特殊階段，其權利義務能力和行為能力均減小，受到相應限制。不過清算期間，公司仍具有法人資格，可以參加民事訴訟。
清算完成后，公司法人資格能力進一步縮小。只剩下些許義務，比如償還債務。
清算之后，公司正式進入注銷程序，一般來說，注銷的整個過程需6-12個月時間。注銷完成后，公司法人資格消滅。
公司被撤銷一般是由于公司存在某些法定的不可存在的現(xiàn)象，比如登記機關事后發(fā)現(xiàn)公司登記時的資料有問題。撤銷是一種對行政許可的法律收回行為，是公司注銷的一個原因。公司被吊銷一般是由于公司違反了相關的規(guī)定或沒有履行相應義務，比如沒有年報。吊銷是一種對公司的處罰行為，也是公司注銷的一個原因。
而公司注銷可以是主動行為例如執(zhí)照期滿不續(xù)，也可以是被動行為，例如公司被撤銷或被吊銷之后都應該按照法律規(guī)定進行清算并注銷。
制作清算報告，報股東會、股東大會或者人民法院確認后，申請注銷公司登記，公告公司終止。公司清算結(jié)束后，清算組應當制作清算報告，報股東會、股東大會或者人民法院確認，并報送公司登記機關，申請注銷公司登記，公告公司終止。2019年1月10日，新聞辦公室召開發(fā)布會，國家市場監(jiān)管總局副局長馬正其和國家稅務總局征管和科技發(fā)展司司長饒立新詳細解讀了推進企業(yè)注銷便利化的措施。《通知》在保障市場交易秩序和交易安全的基礎上，通過進一步精簡文書材料、優(yōu)化流程，強化部門信息共享和業(yè)務協(xié)同，推行企業(yè)注銷“一網(wǎng)”服務。
不運營的公司干脆選擇不報稅，不注銷,也許有人認為公司不注銷也沒什么大不了，反正公司沒業(yè)務往來了，賬戶也沒錢了，工商部門拿自己沒辦法。其實不然，國家對于不注銷、不報稅的公司早就有明文規(guī)定的處罰，不運營的公司一定要及時注銷。就像想開公司一定要在工商局注冊一樣。
先在報紙上刊登清算報告,向社會公示一般公示期為45天，然后第二天到工商局提交申請注銷備案。稅務（國稅和地稅）辦理注銷手續(xù)，稅局會對賬務進行檢查，對于要補稅的會要求補繳稅款。辦理社保注銷，有辦理社保要去進行社保注銷，沒有辦理社保則不需要。工商注銷(在報紙上刊登清算報告)45天后到工商局辦理。
當前，自主創(chuàng)業(yè)門坎愈來愈低，而注銷門坎卻居高不下，多證合一，1次工商注冊登記就在許多 職能部門申請辦理了備案。隨后直到有一日你需要注銷的時候，每一個職能部門都不可以有什么問題，注銷需要了解營業(yè)執(zhí)照注銷流程。有很多經(jīng)營者不愿意注銷公司，一個是嫌麻煩，二是怕花錢。可是要提示大家的是公司不運營了注銷，不然后患無窮。
有沒有遇到注冊公司的時候，填進來身份信息，立即彈出來預警信息“國家局信用黑名單”。工商信用黑名單分成、地方級，但要解決都先去注冊公司所在區(qū)域的工商管理局找出根本原因，進行下一步解決。